Spolupráce

Jsme plně otevřeni spolupráci ve všech oblastech našeho výzkumu jak s experimentálními tak s výpočetními skupinami. Máme širokou řadu mezinárodních spoluprací po celém světě s předními skupinami v oblasti výpočetní chemie a experimentů. Mezi nejnovější aktivní spolupráce patří:

 

Prof. Michal Otyepka, Prof. Petr Jurečka, Prof. Pavel Banáš, Dr. Marie Zgarbová (Univerzita Palackého, Olomouc, Česká republika) - Strukturní dynamika RNA a proteinů, silová pole NA, kvantová chemie

Prof. Ernesto Di Mauro (Univerzita Sapienza, Řím, Itálie) - polymerace prebiotických prekurzorů, katalytická aktivita krátkých oligonukleotidových sekvencí

Prof. Svatopluk Civiš, Dr. Martin Ferus (Ústav fyzikální chemie J. Heyrovského, AV ČR, Praha) - mechanismus syntézy jednoduchých prebiotických stavebních bloků ve vysokoenergetických podmínkách

Prof. Robert W. Góra (Wroclaw University of Technology, Wroclaw, Polsko) - fotochemické procesy související se vznikem života

Prof. S. Grimme (Univ Bonn, Inst Phys & Theoret Chem, Mulliken Ctr Theoret Chem, Bonn, Německo) – QM výpočty nukleových kyselin

Dr. G. Bussi (SISSA, Terst, Itálie) - simulace nukleových kyselin

Jaroslav Koča (Masarykova univerzita, Brno, Česká republika) - molekulární modelování

Prof. Nils G. Walter (University of Michigan, Ann Arbor, USA) - struktura, dynamika a interakce katalytické RNA

Prof. Neocles B. Leontis, Prof. Craig L. Zirbel (Bowling Green State University, Ohio, USA) - molekulární interakce v ribozomech, RNA bioinformatika

Dr. Filip Lankaš (VŠCHT Praha, Česká republika) – elasticita nukleových kyselin.

Prof. F. Javier Luque (University of Barcelona, ​​Španělsko) - teoretické studium nukleových kyselin

Prof. Modesto Orozco (University of Barcelona, ​​Španělsko) - teoretické studie nukleových kyselin

Prof. F. H. T. Allain (Inst Mol Biol & Biophys, Dept Biol, Švýcarsko) – protein-RNA komplexy

Prof. M. Nowotny (Int Inst Mol & Cell Biol, Lab Prot Struct, Varšava, Polsko) - protein-RNA komplexy

Prof. J. Trylska (Univ Warsaw, Ctr New Technol, Varšava, Polsko) – RNA simulace

Prof. John Sutherland (University of Cambridge, Cambridge, UK) - fotochemické procesy související se vznikem života

Prof. Thomas E. Cheatham, III (University of Utah, Salt Lake City, USA) – NA MD simulace.

Dr. Lukáš Trantírek (Masarykova univerzita, Brno, Česká republika) - DNA quadruplexy.

Dr. Karel Kubíček (Masarykova univerzita, Brno, Česká republika) – interakce DNA-platina

Dr. Richard Štefl (Masarykova univerzita, Brno, Česká republika) – interakce protein–RNA.

Prof. J.A. Platts (Cardiff Univ, Sch Chem, Cardiff, Wales) – QM výpočty nukleových kyselin.

Nohad Gresh (L’Université Paris Descartes, Paříž, Francie) - parametrizace polarizovatelného silového pole SIBFA

Dr. S. Pasquali (Univ Paris Diderot, Lab Biochim Theor, IBPC, Francie) – coarse grain modelování nukleových kyselin

Luc Van Meervelt (Katholieke Universiteit Leuven, Belgie) – chemicky modifikované nukleové kyseliny

Dr. S. Campagne (ETH Zurich, NMR, X-ray crystallography and biochemical methods)

Prof. J. Wöhnert (Goethe-Universität Frankfurt am Main; NMR)

Prof. R. Wigneshweraraj (Imperial College London, biochemical methods),

Dr. Pascal Auffinger (IBMC, CNRS, Strasbourg, structural bioinformatics).